Yosun aslında bir bitkidir ve güneş ışınlarından karbondioksit kullanarak beslenip büyürler. Yosunun ürettiği bakterilerin çoğalması için iyi bir güç kaynağıdır. Aynı zamanda klorun yosunla reaksiyona girmesiyle yüksek miktarda klor ihtiyacı doğar. Bunun sonucu pH’nın yükselmesi ve yüksek pH'larda kalan klorun etkisi daha da azalır.

Yosunun kontrolsüz çoğalması havuzu bulandırır, suyu yeşile döndürür, havuzun zeminini kayganlaştırır ve pis kokulara neden olabilir. Ayrıca havuzun yüzeylerine lekeler yapabilir.

Yosun kuruduğunda, mantar gibi toz şeklinde sporlar havaya uçar. Bir tanesi suya düştüğü anda canlanıp çoğalmaya başlar. Eğer havuzda klor (az da olsa ) varsa suya düşen sporlar ölür ve havuz temiz kalır. Ama havuz klordan yoksun kalırsa (birkaç saatliğine bile) yosun hızlı bir şekilde üreyip çoğalır.

Havuzlarda yosunu renginden tanırız. En yaygın ve yok etmesi en kolay olanı yeşil yosundur. Aynı zamanda en hızlı üreyen türüdür.

Siyah yosun ile mücadele etmek çok zordur. Bunun nedeni de yosunun üst üste tabaka şeklinde kalınlaşması ve sıvalar ya da derz aralarında kendini gömmesidir. Havuza ilave edilen kimyasallar üst tabakayı öldürür ama bu ölen hücreleri alt tabaka için koruyucu kalkan olarak yapışık kalır. Siyah yosunu yok etmek için sık sık fırçalamak gerekir.

Dezenfeksiyon sisteminin düzenli uygulanması halinde yosun üremesi kontrol altına alınabilir. Dezenfeksiyonun önde gelen maddelerinden klor benzeri dezenfektan ürünleri yosun oluşmasını engelleyen etkiye sahiptir. Serbest klorun yeterli düzeyde olmasına dikkat edilmelidir.

Yosun oluşması halinde şok klorlama yapılmalı, havuz bordürleri, duvarları fırçalanmalı, vakum süpürgesi ile de dip temizliği yapılmalıdır. Yosun mücadelesinde kullanılacak kimyasal maddeler için kullanma talimatlarındaki değerlere mutlaka uyulmalıdır. Yosun mücadelesi sırasında havuz kesinlikle kullanılmamalıdır.